Původ obce Krty je ryze Slovanský, jednak je typická okrouhlice.
Jméno obce jest podle pověsti jménem jistého čeledína. Stařešina rodu se jmenoval Krt od slovanského jména a tudy povstalo jméno Krty.
Není žádných zpráv, že by obec Krty byla osídlena již v pravěku, tehdejších dávných časů vystupují Krty až v roce 1227, kdy patřila nynější obec ku hradu Rabštejnu. Tehdy byla majetkem Libštejnu z Kolovrat. Po smrti Jaroslava staršího Libštejnského z Kolovrat přešly jako děditství jeho synu Benediktovi.
